Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控静态全景图

北海道大学的研究成果医务人员和RIKEN Research研究成果所的助手们从未建起了首个针对自身致病性病症和自身增生性病症的基因组数据集库。希望这一人力能为致病病症的发展提供新的见解，并显然有助于药物的挖掘借助于。研究团队们还希望，与致病涉及的氨基酸数据集图谱终于显然应用于诸如COVID-19等疟疾的研究成果。

北海道大学项目研究成果秘书，治疗风湿病学家，新功能氨基酸学研究专家Mineto OtaClark真是：“要明白病症，就必须深刻理解基因组变异的新功能。有了这个数据集集，我们就可以将与病症涉及的DNA氨基酸转变的数据集与对病症发作有助于十分最重要的基因组和肝细胞各种类型联系起来。”Ota是该一个团队公开发表在《Cell》杂志上的短文的主要作者，短文曲名为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的研究团队们合作透过的。

作者写道，致病内源性的病症（IMD）包括从自身致病性到自身增生的多种组织学。他们指借助于，尽管IMD里炎性STAT的异常户外活动表明致病肝细胞新功能再次发生了转变，但是，“对于IMD的涉及基因组甚至涉及肝细胞各种类型知之甚少。”

以外氨基酸相似之处研究成果（GWAS）挖掘借助于了许多与IMD涉及的氨基酸启动子。但是，在此类相似之处研究成果里鉴定借助于的许多基因组变异都设在调节基因组“on”或“off”传达的DNA非字节周边地区，而不是设在基因组字节氨基酸里。研究成果小组指借助于：“GWAS从未推断借助于了许多与复杂遗传和病症涉及的氨基酸启动子，包括IMD。这些变异里的大多数都设在非字节氨基酸周边地区，特别是管控元件，如增强子和启动子。”

为了推断借助于管控DNA的新功能，一种不尽相近各种类型的氨基酸分析，称为传达定量遗传基因组启动子（eQTL），有助于将DNA氨基酸的不同与基因组传达的不同联系起来。利用eQTL数据集，研究成果医务人员可以对管控DNA氨基酸的目的、管控氨基酸里的变异如何严重影响其管控基因组的传达以及这些基因组传达不同如何导致病症做借助于非常自大的怀疑。

其它针对致病的eQTL研究成果从未在透过里，但非常进一步的研究成果工作只包括卫生自愿者，并检查了受限制生产量的肝细胞各种类型。研究成果医务人员写道：“对卫生诱导致病肝细胞的研究成果显然无法捕获病症静止状态下挖掘借助于的一系列eQTL不稳定性。此外，虽然对致病肝细胞的实验性诱导可以在无论如何上模拟病症静止状态，但这不只不过反映借助于体内的内分泌环境污染。”

Ota补足道：“增生静止状态下，致病肝细胞的物理特性与卫生静止状态下的相近肝细胞截然不尽相近。与致病原因涉及的基因组变异显然只在患病静止状态下起依赖性，因此对于这种各种类型的基因组研究成果，从真实病症身上换取样本十分最重要。”

在他们简介报道的研究成果里，研究成果小组对79名卫生自愿者和337名被治疗患有10种不尽相近各种类型致病内源性病症（包括类风湿性关节炎、系统地红斑狼疮和系统地硬化症）的病症透过了以外氨基酸测序。所有自愿者都是日本国后代。

明白致病内源性的病症具有挑战性，因为尽管每种病症在治疗上都是不尽相近的，但仍有许多重叠之处，并且具有相近治疗的病症显然会展现借助于十分不尽相近的症状。研究成果医务人员补足真是：“由于所有这些动植物，一次学习一种致病内源性病症的能力是受限制的。但是，如果我们一起研究成果10种病症，就可以非常年初地明白这些各种类型的病症。”

在完成以外氨基酸测序后，研究成果医务人员从自愿者的肠道样本里所含28种不尽相近各种类型的致病涉及肝细胞，并观测了这些肝细胞里的基因组传达。“我们在图谱里看到，每种致病肝细胞各种类型都有不尽相近的eQTL结果，这可以告诉我们肝细胞各种类型两者之间基因组管控的不同，以及哪种肝细胞各种类型对于发展哪种病症至关最重要。”研究成果医务人员真是。

作者通报真是，“在基因组传达分析里，我们在一个SDK上对多个IMD透过比较，使我们只能描述每个病症（病症）的形态，并标识与单个病症特异性涉及的基因组，以及在一组IMD里失调的闭环……我们的数据集集使我们只能侦测每个特定肝细胞各种类型里eQTL不稳定性的内分泌（病症）背景马达的干扰。”

研究成果医务人员将得到的人力取名为北海道大学致病肝细胞基因组传达图谱（ImmuNexUT），并真是它亦然了用作东亚后代自愿者建起的最大的eQTL数据集集。他们总结道：“我们确定了致病肝细胞各种类型特异性的eQTL不稳定性，包括以前未报道的有名肝细胞各种类型，它们在内分泌增生条件下的动植物，以及这些eQTL与IMD遗传两者之间的特别是在相似之处。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的氨基酸和新功能氨基酸研究成果主要是利用欧洲各国捐**透过的，尽管小团体动植物对于有用理解氨基酸新功能至关最重要。”研究成果医务人员真是，“这个日本国病患的eQTL图谱对于解决这种以欧洲各国为里心的性取向，结合欧洲各国的数据集集进一步研究成果DNA变异的新功能，也具有最重要意义。”

研究成果医务人员希望ImmuNexUT数据集库将暂时增长，并终于为病症带来非常容易的结果。他们真是：“与之前报道的人力相比，我们的数据集集具有独特而稳固的特色，包括年初的致病肝细胞细分、捐**两者之间致病原因的转变以及其本质的非欧洲各国捐**。”